企业转让沪深上市公司股份纳税
A. 代持股转让是否征个人所得税
代持股，变更代持人，不征个人所得税。
代持股的所有权人转让，要征个人所得税
股权转让属于个税中财产转让科目，应该按照一次转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额按20%的税率计算个税。不过，个人在上海、深圳证券交易所转让上市公司股票获取的所得，暂免缴纳个人所得税。所以，如果你所说的股权转让是在沪深股市上交易的，就暂免纳税，但如果是签合同转让的，就要纳税了
B. 个人转让股票需要交税吗个人转让股权需要交税吗
股权转让，是公司股东依法将自己的股东权益有偿转让给他人，使他人取得股权的民事法律行为。
股权转让过程中，转让方需要交纳各种税费。
当转让方是个人
如果转让方是个人，要交纳个人所得税，按照20%缴纳。
当转让方是公司
如果转让方是公司，则需要涉及的税费较多，详见参考资料《公司股权转让的税费处理》。具体如下:
(一)内资企业转让股权涉及的税种公司将股权转让给某公司，该股权转让所得，将涉及到企业所得税、营业税、契税、印花税等相关问题：
1、企业所得税
(1)企业在一般的股权(包括转让股票或股份)买卖中，应按《国家税务总局关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知》(国税发(2000)118号，废止)有关规定执行。股权转让人应分享的被投资方累计未分配利润或累计盈余公积金应确认为股权转让所得，不得确认为股息性质的所得。
(2)企业进行清算或转让全资子公司以及持股95%以上的企业时，应按《国家税务总局关于印发<企业改组改制中若干所得税业务问题的暂行规定>的通知》(国税发(1998)97号，废止)的有关规定执行。投资方应分享的被投资方累计未分配利润和累计盈余公积应确认为投资方股息性质的所得。为避免对税后利润重复征税，影响企业改组活动，在计算投资方的股权转让所得时，允许从转让收入中减除上述股息性质的所得。
(3)按照《国家税务总局关于执行<企业会计制度>需要明确的有关所得税问题的通知》(国税发(2003)45号)第三条规定，企业已提取减值、跌价或坏帐准备的资产，如果有关准备在申报纳税时已调增应纳税所得，转让处置有关资产而冲销的相关准备应允许作相反的纳税调整。因此，企业清算或转让子公司(或独立核算的分公司)的全部股权时，被清算或被转让企业应按过去已冲销并调增应纳税所得的坏帐准备等各项资产减值准备的数额，相应调减应纳税所得，增加未分配利润，转让人(或投资方)按享有的权益份额确认为股息性质的所得。
企业股权投资转让所得和损失的所得税处理
(4)企业股权投资转让所得或损失是指企业因收回、转让或清算处置股权投资的收入减除股权投资成本后的余额。企业股权投资转让所得应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税。
(5)企业因收回、转让或清算处置股权投资而发生的股权投资损失，可以在税前扣除，但每一纳税年度扣除的股权投资损失，不得超过当年实现的股权投资收益和投资转让所得，超过部分可无限期向以后纳税年度结转扣除。
2、营业税
根据《财政部、国家税务总局关于股权转让有关营业税问题的通知》(财税191号)规定：
(一)以无形资产、不动产投资入股，与接受投资方利润分配，共同承担投资风险的行为，不征收营业税。
(二)自2003年1月1日起，对股权转让不征收营业税。
3、契税
根据规定，在股权转让中，单位、个人承受企业股权，企业的土地、房屋权属不发生转移，不征契税;在增资扩股中，对以土地、房屋权属作价入股或作为出资投入企业的，征收契税。”
4、印花税股权转让的征税问题
股权转让存在两种情况：一是在上海、深圳证券交易所交易或托管的企业发生的股权转让，对转让行为应按证券(股票)交易印花税3‰的税率征收证券(股票)交易印花税。二是不在上海、深圳证券交易所交易或托管的企业发生的股权转让，对此转让应按1991年9月18日《国家税务总关于印花税若干具体问题的解释和规定的通知》(国税发1号)文件第十条规定执行，由立据双方依据协议价格(即所载金额)的万分之五的税率计征印花税。
(二)内资企业股权转让的所得税处理
根据国家税务总局《关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知》(国税发118号，废止)的规定：
企业股权投资转让所得或损失是指企业因收回、转让或清算处置股权投资的收入减除股权投资成本后的余额。企业股权投资转让所得应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税。
被投资企业对投资方的分配支付额，如果超过被投资企业的累计未分配利润和累计盈余公积金而低于投资方的投资成本的，视为投资回收，应冲减投资成本;超过投资成本的部分，视为投资方企业的股权转让所得，应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税。
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D. 股票转让所得是否免征个人所得税
股票转让免征个人所得税是特指上市公司的股票转让。而非上市公司的股票转让是要征个人所得税的。按照财产转让所得征收净所得的20%。
股票持有人通过买卖、赠与和交易等方式依法将股票让渡给他人。股票转让后，股票原持有人丧失依据该股票拥有的权利，受让人即股票新持有人取得股东地位。由于股票转让只改变股票持有人而不影响公司的存在和资本，各国公司法均允许股票转让。股票转让以自由转让为原则，但各国法律也有不同的限制。
(1)股票转让必须在公司设立登记后才能进行；
(2)公司发起人在公司设立登记后一定时间内不得转让自己的股票；
(3)不得向非本国公民转让股票；
(4)持股雇员未经董事会批准或公司章程没有规定的，不得向本公司雇员以外的人转让股份；
(5)股份有限公司一般不得接受转让本公司股票；
(6)不公开发行股票公司的股票持有人不得通过证券交易所转让股票，不得侵犯本公司其他股东的优先购买权，等等。股票转让必须遵守法定程序。不记名股票一般因股票交付完成转让。记名股票须依法办理股票过户手续，转让始得生效。
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F. 上市公司股票如何缴纳增值税
增值税适用税率6%。依据《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知财内税〔2016〕36号》文件附件一“第容三章 税率和征收率”第十五条增值税税率：
（一）纳税人发生应税行为，除本条第（二）项、第（三）项、第（四）项规定外，税率为6％。
（二）提供交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务，销售不动产，转让土地使用权，税率为11%（现改为10%）。
（三）提供有形动产租赁服务，税率为17%（现改为16%）。
（四）境内单位和个人发生的跨境应税行为，税率为零。具体范围由财政部和国家税务总局另行规定。
(6)企业转让沪深上市公司股份纳税扩展阅读
由于增值税实行凭增值税专用发票抵扣税款的制度，因此对纳税人的会计核算水平要求较高，要求能够准确核算销项税额、进项税额和应纳税额。
但实际情况是有众多的纳税人达不到这一要求，因此《中华人民共和国增值税暂行条例》将纳税人按其经营规模大小以及会计核算是否健全划分为一般纳税人和小规模纳税人。
具体划分标准为：生产型纳税人，年增值税应税销售额为50万元人民币；批发、零售等非生产型纳税人，年增值税应税销售额为80万元人民币。
G. “新三板”限售股转让要交个税吗
为了促进股票市场的稳健发展，我国针对上市公司实施了特殊的税收政策，《关于个人转让股票所得继续暂免征收个人所得税的通知》（财税字[1998]61号）规定：“从1997年1月1日起，对个人转让上市公司股票取得的所得继续暂免征收个人所得税。”而针对限售股，根据财政部、国家税务总局和证监会联合发布《关于个人转让上市公司限售股所得征收个人所得税有关问题的通知》的规定，自2010年1月1日起，对个人转让上市公司限售股取得的所得按20%税率征收个人所得税。
一、新三板公司是上市公司么？
“新三板”全称为全国中小企业股份转让系统，根据《国务院关于全国中小企业股份转让系统有关问题的决定》（国发〔2013〕49号）的规定，对其“依法纳入非上市公众公司监管”。可见，国务院明确将新三板公司界定为“非上市公众公司”，近日，财政部、国家税务总局联合印发《关于完善股权激励和技术入股有关所得税政策的通知》（财税〔2016〕101号）也明确指出，“新三板”（全国中小企业股份转让系统挂牌公司）按照非上市公司股权激励税收优惠政策执行。
二、新三板限售股转让税收政策适用
根据特别法优于一般法的原则，针对新三板交易中的涉税事项，如果有明确规定的，适用具体的文件规定；如果没有明确的规定，根据《国务院关于全国中小企业股份转让系统有关问题的决定》（国发〔2013〕49号），“市场建设中涉及税收政策的，原则上比照上市公司投资者的税收政策处理”。
如果参照上市公司的税收政策，关于限售股的规定，有两个比较具体的文件，《关于个人转让上市公司限售股所得征收个人所得税有关问题的通知》（财税[2009]167号），以及《关于个人转让上市公司限售股所得征收个税有关问题的补充通知》，明确7种法定情形属于上市公司限售股范畴，需要缴纳个人所得税。
事实上，将新三板界定为非上市公司后，更加符合逻辑的做法是应该直接适用有关股权转让的一般规定，根据国家税务总局发布的《股权转让所得个人所得税管理办法（试行）》（国家税务总局公告2014年第67号）的规定，对以下7种情形均征税：（1）出售股权；（2）公司回购股权；（3）发行人首次公开发行新股时，被投资企业股东将其持有的股份以公开发行方式一并向投资者发售；（4）股权被司法或行政机关强制过户；（5）以股权对外投资或进行其他非货币性交易；（6）以股权抵偿债务；（7）其他股权转移行为。
同时，该文件的第三十条明确：“个人在上海证券交易所、深圳证券交易所转让从上市公司公开发行和转让市场取得的上市公司股票，转让限售股，以及其他有特别规定的股权转让，不适用本办法”。由于，新三板限售股并无特别规定，从税收政策适用上来看，新三板转让限售股适用67号文是没有问题的。
三、新三板限售股范围
四、纳税地点及税务风险
根据《股权转让所得个人所得税管理办法（试行）》（国家税务总局公告2014年第67号），个人股权转让所得个人所得税，以股权转让方为纳税人，以受让方为扣缴义务人。同时明确规定，个人股权转让所得个人所得税以被投资企业所在地地税机关为主管税务机关。对于“申报的股权转让收入明显偏低且无正当理由的”，税务机关可以按照净资产核定法、类比法等进行核定股权转让收入，因此通过协议转让进行的“一分钱”转让等“税务筹划”也面临潜在的纳税调整风险。
总结：
目前，国家针对新三板交易，已经出台了印花税、个人股息红利的税收政策，对于其他税种等事项并未予以明确；按照国务院出台的文件精神，可以参考对沪深两市投资者已经出台的有关税收政策。需要指出的是，近年来，股权转让引发的税务争议越来越多，华税建议，新三板交易双方需要在交易前明确应该履行的纳税义务，同时，交易双方在不违反国家法律、法规规定的前提下，可以进行一定税务筹划，以降低交易税负。